目的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型是指極短范圍內(nèi)多個甲基化位點的組合，其單倍型具有豐富的多樣性。 篩選和驗證小鼠血液中年齡相關(guān)的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型。
方法 首先，構(gòu)建基于小鼠參考基因組的 ＤＮＡ 甲基化 微單倍型理論數(shù)據(jù)集。 其次，利用網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫中小鼠血液 ＤＮＡ 甲基化高通量測序信息，采用 Ｓｐｅａｒｍａｎ 秩相關(guān)分析 方法篩選年齡相關(guān)的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型。 最后，以驗證數(shù)據(jù)集交叉驗證。
結(jié)果 小鼠基因組中 ５０ ｂｐ 范圍內(nèi)的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型位點數(shù)量共計 ６７８７ １４２ 個，由個位數(shù)的 ＣｐＧ 位點所組成的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型占比 ９８.６４％。 在 ５８ 個小鼠血液樣本中共篩選出 ５８３５ 個年齡相關(guān)的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型（ Ｓｐｅａｒｍａｎ 秩相關(guān)檢驗， ｜ｒｈｏ ｜ ＞ ０.５， Ｐ ＜ ０.０１），在 ＤＮＡ 甲基化微單倍型中占 ０.０８６％。 最后，在 ９５ 例獨立的樣本中對具有高相關(guān)性的前 １００ 個年齡相關(guān)的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型進行驗證，最終得到 ４４ 個位點。
結(jié)論 本研究篩選出的年齡相關(guān)的 ＤＮＡ 甲基化微單倍型可以為后續(xù)小鼠血液表觀年齡預(yù)測及衰老研究提供借鑒。
閱讀原文：小鼠血液中年齡相關(guān)的ＤＮＡ甲基化微單倍型的篩選與驗證.pdf
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